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首页 / 操作系统 / Linux / Ubuntu 11.04 下安装R

方法1在Ubuntu软件中心搜索 r-base 直接安装或者添加源,然后通过apt-get安装:
  1. sudo apt-get install r-base  
------------------------------------------------------方法2下载R的源码包(http://www.r-project.org/),比如:R-2.13.0.tar.gz解压:
  1. tar -zvxf R-2.13.0.tar.gz  
配置:
  1. cd R-2.13.0  
  2. ./configure --prefix=/home/xxx/R --enable-R-shlib   
prefix设置R的安装路径,enable-R-shlib可以保证lib目录下的动态库能够共享如果提示G77错误
  1. sudo apt-get install build-essential  
  2. sudo apt-get install gfortran  
如果提示错误:configure:error:--with-readline=yes(default)...
  1. sudo apt-get install libreadline6-dev  
如果提示错误:configure:error:--with-x=yes(default) and X11...
  1. sudo apt-get install libxt-dev  
安装:
  1. make  
  2. make install  
link到bin目录下:
  1. cd /bin  
  2. sudo ln -sv /home/xxx/R/bin/R  
至此安装完毕。------------------------------------------------------
安装pkg:终端下输入:R
  1. source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")  
  2. biocLite()  
默认将安装一下几个包affy affydata affyPLMannaffy annotate BiobaseBiostrings DynDoc gcrmagenefilter geneplotter hgu95av2limma marray matchprobesmulttest ROC vsnxtable affyQCReport如果需要Bioconductor上别的包的话,可以使用biocLite(c("pkg1", "pkg2"))如:
  1. biocLite(c("copula", "pspline"))  
安装CRAN上的包
  1. install.packages(c("pkg1", "pkg2"))  
来安装(pkg1和pkg2为需要安装的包)。
------------------------------------------------------
编辑器:1.直接shell。终端输入R,就进入R命令行了。2.安装GUI:Rcmdr
  1. sudo apt-get install r-cran-rodbc  
  2. sudo apt-get install r-cran-rcmdr  
运行R后,library(Rcmdr)就可以打开图形界面。

3.用emacs通过软件中心搜索emacs ess直接安装。打开emacsM-x R
输入R的路径,就进入R编辑模式了。emacs中可以用下面三条指令把正在编辑的程序文本送给R运行:C-c C-n 当前行
C-c C-c 当前段
C-c C-b 当前整个文件Ubuntu 11.04 下 安装 Matlab R2010bUbuntu 11.04 使用Compiz标题栏丢失解决方案相关资讯      Ubuntu 11.04 
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