Welcome 微信登录

首页 / 操作系统 / Linux / Ubuntu 10.10下简单安装配置R环境

向 /etc/apt/sources.list 中加入:deb http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/bin/linux/Ubuntu maverick/Secure aptThe Ubuntu archives on CRAN are signed with the key of "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" with key ID E084DAB9. You can fetch this key withgpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key E084DAB9and then feed it to apt-key withgpg -a --export E084DAB9 | sudo apt-key add -安装完整的R system, 使用sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base管理和维护R包The R packages part of the Ubuntu r-base and r-recommended packages are installed into the directory /usr/lib/R/library.
The other r-cran-* packages shipped with Ubuntu are installed into the directory /usr/lib/R/site-library.
These can be updated using apt-get withsudo apt-get update
sudo apt-get upgrade整体分为三部分进行管理:
1. R本身 和一些库 用 apt-get 进行更新
2. 官方推荐包 默认存在于 /usr/lib/R/library 可用管理员权限下的 update.packages() 更新
3. 用户安装包 默认存在于 /usr/lib/R/site-library 可用管理员权限下的 update.packages() 更新如果用非管理员的用户去装包, 会装到另外一个新文件夹中. 因为对以上目录没有写权限.如果用非管理员权限装包, 会装到另外一个新文件夹中. 因为对以上目录没有写权限. 用管理员权限会默认装到 /usr/local/lib/R/site-library 里. 更新的时候亦然.sudo gedit /etc/R/Rprofile.site  # 修改默认CRAN镜像手工安装依赖了特别库的包安装程序包"Cairo"时退出狀態的值不为0
安装程序包"rgl"时退出狀態的值不为0
安装程序包"XML"时退出狀態的值不为0:
安装程序包"RCurl"时退出狀態的值不为0
安装程序包"cairoDevice"时退出狀態的值不为0
安装程序包"fftw"时退出狀態的值不为0
安装程序包"rcdd"时退出狀態的值不为0
安装程序包"rgdal"时退出狀態的值不为0
依赖rgl引起的:
installation of package "ks" had non-zero exit status
installation of package "feature" had non-zero exit status
installation of package "flowCore" had non-zero exit status
installation of package "flowViz" had non-zero exit status 安装Cairo:sudo apt-get install libcairo2-dev libxt-dev然后install.packages("Cairo")即可安装cairoDevice:sudo apt-get install r-cran-cairoDevice安装rgl包:sudo apt-get install r-cran-rgl安装fftw包:sudo apt-get install libfftw3-dev然后install.packages("fftw")即可安装rcdd包:sudo apt-get install libgmp3-dev然后install.packages("rcdd")即可安装rgdal包:sudo apt-get install libgdal-dev libproj-dev然后install.packages("rgdal")即可安装XML包:sudo apt-get install libxml++2.6-dev然后install.packages("XML")即可装好以上就能装RCurl了, 初步猜测可能是依赖libxml导致的.安装rimages包:sudo apt-get install fftw-dev fftw2然后install.packages("rimage")即可安装RKWard daily版
sudo add-apt-repository ppa:rkward-devel/rkward-dailys然后sudo apt-get update
sudo apt-get install rkward
sudo apt-get dist-upgrade即可安装RKWard daily版.Ubuntu下使用icc/ifort/MKL编译R及性能实测Unix下部署服务的常用指令学习相关资讯      R 
  • Ubntu 14.04 LTS 下编译安装R   (04/04/2015 21:49:34)
  • 在Hadoop集群上运行R程序--安装  (07/21/2012 10:24:24)
  • RStudio Linux Server 版本 安装配  (03/05/2012 13:43:41)
  • R-2.15.1 在 Fedora 16 上的安装(  (07/30/2012 14:54:26)
  • Ubuntu下使用icc/ifort/MKL编译R及  (07/12/2012 09:26:22)
  • R 语言 Linux 环境 安装 说明  (03/05/2012 13:29:48)
本文评论 查看全部评论 (0)
表情: 姓名: 字数